Protein–RNA interactions for Protein: Q04217

ECM16, Probable ATP-dependent RNA helicase DHR1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ECM16Q04217 SGF29YCL010C 780 nt7.5□□□□□ -1.21
ECM16Q04217 SDH4YDR178W 546 nt7.48□□□□□ -1.21
ECM16Q04217 GPI11YDR302W 660 nt7.48□□□□□ -1.21
ECM16Q04217 YIR042CYIR042C 711 nt7.48□□□□□ -1.21
ECM16Q04217 YUR1YJL139C 1287 nt7.48□□□□□ -1.21
ECM16Q04217 KNS1YLL019C 2214 nt7.48□□□□□ -1.21
ECM16Q04217 YMR027WYMR027W 1413 nt7.47□□□□□ -1.21
ECM16Q04217 MRPL1YDR116C 858 nt7.47□□□□□ -1.21
ECM16Q04217 COA1YIL157C 594 nt7.47□□□□□ -1.21
ECM16Q04217 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt7.47□□□□□ -1.21
ECM16Q04217 TDH2YJR009C 999 nt7.47□□□□□ -1.21
ECM16Q04217 DRE2YKR071C 1047 nt7.47□□□□□ -1.21
ECM16Q04217 YNL200CYNL200C 741 nt7.47□□□□□ -1.21
ECM16Q04217 TMT1YER175C 900 nt7.46□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 IMD1YAR073W 1212 nt7.46□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 CDC1YDR182W 1476 nt7.46□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 RVB2YPL235W 1416 nt7.45□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 ECM14YHR132C 1293 nt7.45□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 DUS4YLR405W 1104 nt7.45□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 DEF1YKL054C 2217 nt7.45□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 POP1YNL221C 2628 nt7.45□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 CRF1YDR223W 1404 nt7.44□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt7.44□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 YDR387CYDR387C 1668 nt7.44□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 GEF1YJR040W 2340 nt7.44□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 FYV1YDR024W 486 nt7.43□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 RRS1YOR294W 612 nt7.43□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 YPR196WYPR196W 1413 nt7.43□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 MCH1YDL054C 1461 nt7.43□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 CEF1YMR213W 1773 nt7.42□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt7.42□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 VPS24YKL041W 675 nt7.42□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 PSR2YLR019W 1194 nt7.42□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 ISC1YER019W 1434 nt7.42□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 YHR145CYHR145C 357 nt7.41□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 PZF1YPR186C 1290 nt7.41□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 HXK2YGL253W 1461 nt7.41□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 IRS4YKR019C 1848 nt7.41□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 RPO26YPR187W 468 nt7.4□□□□□ -1.22
ECM16Q04217 RRP9YPR137W 1722 nt7.4□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 SLX5YDL013W 1860 nt7.4□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 IES1YFL013C 2079 nt7.4□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 MSS1YMR023C 1581 nt7.39□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 ERG1YGR175C 1491 nt7.39□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 YDR278CYDR278C 318 nt7.39□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 BCY1YIL033C 1251 nt7.39□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 LDS1YAL018C 978 nt7.39□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 ACS1YAL054C 2142 nt7.39□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 PAP1YKR002W 1707 nt7.38□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 YLL067CYLL067C 3618 nt7.38□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 MSS116YDR194C 1995 nt7.38□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 YCK1YHR135C 1617 nt7.38□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 SRP101YDR292C 1866 nt7.37□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 TPO3YPR156C 1869 nt7.37□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 RPT3YDR394W 1287 nt7.37□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 IRC7YFR055W 1023 nt7.37□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 NCS6YGL211W 1080 nt7.37□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 MSP1YGR028W 1089 nt7.37□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 TSR3YOR006C 942 nt7.37□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 HXT15YDL245C 1704 nt7.37□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 HXT16YJR158W 1704 nt7.37□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 GPB2YAL056W 2643 nt7.37□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 YTP1YNL237W 1380 nt7.36□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 AI5_BETAQ0075 1065 nt7.36□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 HVG1YER039C 750 nt7.36□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 ARA2YMR041C 1008 nt7.36□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt7.36□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 YMR295CYMR295C 594 nt7.36□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 RNH201YNL072W 924 nt7.36□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 GLN1YPR035W 1113 nt7.36□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 RAP1YNL216W 2484 nt7.36□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 VPS72YDR485C 2388 nt7.35□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 IMA5YJL216C 1746 nt7.35□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 MAK31YCR020C-A 267 nt7.35□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt7.35□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 MED6YHR058C 888 nt7.35□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 CIS3YJL158C 684 nt7.35□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 YLR463CYLR463C 552 nt7.35□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 TSA1YML028W 591 nt7.35□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 YOL163WYOL163W 510 nt7.35□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 SLD7YOR060C 774 nt7.35□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 YPR123CYPR123C 435 nt7.35□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 IFA38YBR159W 1044 nt7.35□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 PET112YBL080C 1626 nt7.34□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 DPB2YPR175W 2070 nt7.34□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 HST3YOR025W 1344 nt7.34□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 YET3YDL072C 612 nt7.34□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 JJJ3YJR097W 519 nt7.34□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 FSF1YOR271C 984 nt7.34□□□□□ -1.23
ECM16Q04217 WHI2YOR043W 1461 nt7.33□□□□□ -1.24
ECM16Q04217 YGR127WYGR127W 939 nt7.33□□□□□ -1.24
ECM16Q04217 MRPL10YNL284C 969 nt7.33□□□□□ -1.24
ECM16Q04217 CAF40YNL288W 1122 nt7.33□□□□□ -1.24
ECM16Q04217 ATG23YLR431C 1362 nt7.33□□□□□ -1.24
ECM16Q04217 ATG7YHR171W 1893 nt7.32□□□□□ -1.24
ECM16Q04217 TEP1YNL128W 1305 nt7.32□□□□□ -1.24
ECM16Q04217 GUD1YDL238C 1470 nt7.32□□□□□ -1.24
ECM16Q04217 PGK1YCR012W 1251 nt7.32□□□□□ -1.24
ECM16Q04217 COX9YDL067C 180 nt7.32□□□□□ -1.24
ECM16Q04217 snR82snR82 268 nt7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.8 ms