Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNFAIP2Q03169 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNFAIP2Q03169 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFAIP2Q03169 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFAIP2Q03169 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms