Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNB1Q02641 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNB1Q02641 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CACNB1Q02641 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms