Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
DSG1Q02413 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DSG1Q02413 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DSG1Q02413 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DSG1Q02413 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms