Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BDH1Q02338 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BDH1Q02338 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms