Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYP27A1Q02318 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYP27A1Q02318 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYP27A1Q02318 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYP27A1Q02318 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYP27A1Q02318 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYP27A1Q02318 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYP27A1Q02318 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CYP27A1Q02318 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYP27A1Q02318 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYP27A1Q02318 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYP27A1Q02318 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms