Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EXOSC10Q01780 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
EXOSC10Q01780 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EXOSC10Q01780 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms