Protein–RNA interactions for Protein: Q01581

HMGCS1, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS1Q01581 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGCS1Q01581 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGCS1Q01581 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGCS1Q01581 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms