Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A2Q01362 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A2Q01362 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MS4A2Q01362 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A2Q01362 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms