Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAD3P84022 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMAD3P84022 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMAD3P84022 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMAD3P84022 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms