Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX3P78415 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX3P78415 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRX3P78415 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRX3P78415 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRX3P78415 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRX3P78415 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRX3P78415 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRX3P78415 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRX3P78415 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRX3P78415 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRX3P78415 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRX3P78415 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX3P78415 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX3P78415 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX3P78415 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX3P78415 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX3P78415 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX3P78415 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IRX3P78415 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IRX3P78415 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IRX3P78415 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IRX3P78415 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IRX3P78415 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IRX3P78415 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IRX3P78415 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IRX3P78415 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRX3P78415 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRX3P78415 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRX3P78415 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRX3P78415 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRX3P78415 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX3P78415 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX3P78415 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX3P78415 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX3P78415 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX3P78415 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX3P78415 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX3P78415 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX3P78415 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX3P78415 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX3P78415 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX3P78415 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRX3P78415 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
IRX3P78415 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRX3P78415 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRX3P78415 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRX3P78415 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRX3P78415 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IRX3P78415 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IRX3P78415 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRX3P78415 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRX3P78415 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRX3P78415 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRX3P78415 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRX3P78415 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRX3P78415 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRX3P78415 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRX3P78415 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRX3P78415 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRX3P78415 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRX3P78415 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRX3P78415 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRX3P78415 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRX3P78415 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRX3P78415 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
IRX3P78415 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRX3P78415 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRX3P78415 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRX3P78415 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRX3P78415 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRX3P78415 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRX3P78415 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
IRX3P78415 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRX3P78415 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRX3P78415 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRX3P78415 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRX3P78415 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IRX3P78415 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IRX3P78415 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IRX3P78415 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IRX3P78415 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
IRX3P78415 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IRX3P78415 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IRX3P78415 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IRX3P78415 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRX3P78415 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRX3P78415 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRX3P78415 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRX3P78415 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IRX3P78415 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IRX3P78415 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IRX3P78415 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IRX3P78415 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRX3P78415 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRX3P78415 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRX3P78415 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRX3P78415 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRX3P78415 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
IRX3P78415 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms