Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT85P78386 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT85P78386 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT85P78386 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT85P78386 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT85P78386 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT85P78386 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT85P78386 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT85P78386 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT85P78386 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT85P78386 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT85P78386 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT85P78386 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT85P78386 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT85P78386 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT85P78386 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT85P78386 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT85P78386 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT85P78386 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT85P78386 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT85P78386 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT85P78386 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT85P78386 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT85P78386 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT85P78386 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT85P78386 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT85P78386 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT85P78386 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT85P78386 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT85P78386 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT85P78386 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT85P78386 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT85P78386 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT85P78386 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT85P78386 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT85P78386 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT85P78386 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT85P78386 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT85P78386 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT85P78386 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT85P78386 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT85P78386 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT85P78386 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT85P78386 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT85P78386 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT85P78386 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT85P78386 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT85P78386 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT85P78386 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT85P78386 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT85P78386 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT85P78386 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT85P78386 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT85P78386 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT85P78386 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KRT85P78386 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT85P78386 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT85P78386 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT85P78386 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT85P78386 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT85P78386 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT85P78386 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT85P78386 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT85P78386 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT85P78386 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT85P78386 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT85P78386 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT85P78386 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT85P78386 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT85P78386 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.51■■■□□ 2
KRT85P78386 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT85P78386 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT85P78386 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT85P78386 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT85P78386 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT85P78386 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT85P78386 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT85P78386 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT85P78386 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT85P78386 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT85P78386 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT85P78386 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT85P78386 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT85P78386 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT85P78386 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT85P78386 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT85P78386 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT85P78386 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT85P78386 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT85P78386 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT85P78386 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT85P78386 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT85P78386 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT85P78386 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT85P78386 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT85P78386 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT85P78386 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT85P78386 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT85P78386 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT85P78386 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms