Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HBG1P69891 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HBG1P69891 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HBG1P69891 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HBG1P69891 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HBG1P69891 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HBG1P69891 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HBG1P69891 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HBG1P69891 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HBG1P69891 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HBG1P69891 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HBG1P69891 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HBG1P69891 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HBG1P69891 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HBG1P69891 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HBG1P69891 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HBG1P69891 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HBG1P69891 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HBG1P69891 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HBG1P69891 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HBG1P69891 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HBG1P69891 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HBG1P69891 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HBG1P69891 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HBG1P69891 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HBG1P69891 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HBG1P69891 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HBG1P69891 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HBG1P69891 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HBG1P69891 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HBG1P69891 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HBG1P69891 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HBG1P69891 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HBG1P69891 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HBG1P69891 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HBG1P69891 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HBG1P69891 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HBG1P69891 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HBG1P69891 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HBG1P69891 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HBG1P69891 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HBG1P69891 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HBG1P69891 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HBG1P69891 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HBG1P69891 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HBG1P69891 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HBG1P69891 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HBG1P69891 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HBG1P69891 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HBG1P69891 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
HBG1P69891 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HBG1P69891 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HBG1P69891 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HBG1P69891 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HBG1P69891 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HBG1P69891 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HBG1P69891 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HBG1P69891 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HBG1P69891 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HBG1P69891 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HBG1P69891 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HBG1P69891 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HBG1P69891 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HBG1P69891 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HBG1P69891 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HBG1P69891 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HBG1P69891 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HBG1P69891 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HBG1P69891 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HBG1P69891 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HBG1P69891 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HBG1P69891 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HBG1P69891 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HBG1P69891 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HBG1P69891 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HBG1P69891 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HBG1P69891 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HBG1P69891 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HBG1P69891 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HBG1P69891 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HBG1P69891 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HBG1P69891 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HBG1P69891 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HBG1P69891 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HBG1P69891 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HBG1P69891 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HBG1P69891 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HBG1P69891 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HBG1P69891 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HBG1P69891 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HBG1P69891 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HBG1P69891 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HBG1P69891 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HBG1P69891 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HBG1P69891 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HBG1P69891 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HBG1P69891 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HBG1P69891 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HBG1P69891 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HBG1P69891 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms