Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HBBP68871 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HBBP68871 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HBBP68871 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HBBP68871 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HBBP68871 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HBBP68871 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HBBP68871 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HBBP68871 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HBBP68871 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HBBP68871 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HBBP68871 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HBBP68871 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HBBP68871 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HBBP68871 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HBBP68871 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HBBP68871 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HBBP68871 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HBBP68871 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HBBP68871 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HBBP68871 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HBBP68871 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HBBP68871 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HBBP68871 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HBBP68871 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HBBP68871 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HBBP68871 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HBBP68871 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HBBP68871 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HBBP68871 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HBBP68871 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HBBP68871 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HBBP68871 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HBBP68871 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HBBP68871 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HBBP68871 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HBBP68871 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HBBP68871 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HBBP68871 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HBBP68871 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HBBP68871 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HBBP68871 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HBBP68871 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HBBP68871 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HBBP68871 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HBBP68871 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HBBP68871 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HBBP68871 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HBBP68871 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HBBP68871 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HBBP68871 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HBBP68871 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HBBP68871 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HBBP68871 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HBBP68871 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HBBP68871 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HBBP68871 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HBBP68871 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HBBP68871 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HBBP68871 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HBBP68871 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HBBP68871 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HBBP68871 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HBBP68871 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HBBP68871 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HBBP68871 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HBBP68871 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HBBP68871 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HBBP68871 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HBBP68871 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HBBP68871 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HBBP68871 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HBBP68871 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HBBP68871 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HBBP68871 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HBBP68871 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HBBP68871 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HBBP68871 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HBBP68871 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HBBP68871 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HBBP68871 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HBBP68871 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HBBP68871 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HBBP68871 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HBBP68871 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HBBP68871 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HBBP68871 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HBBP68871 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HBBP68871 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HBBP68871 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HBBP68871 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HBBP68871 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HBBP68871 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HBBP68871 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HBBP68871 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HBBP68871 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HBBP68871 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HBBP68871 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HBBP68871 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HBBP68871 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms