Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBB4BP68371 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB4BP68371 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB4BP68371 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms