Protein–RNA interactions for Protein: P63173

RPL38, 60S ribosomal protein L38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL38P63173 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL38P63173 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL38P63173 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL38P63173 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPL38P63173 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPL38P63173 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL38P63173 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL38P63173 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL38P63173 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL38P63173 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL38P63173 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL38P63173 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL38P63173 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL38P63173 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL38P63173 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL38P63173 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL38P63173 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL38P63173 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL38P63173 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL38P63173 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL38P63173 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL38P63173 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL38P63173 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL38P63173 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL38P63173 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL38P63173 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL38P63173 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL38P63173 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL38P63173 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL38P63173 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL38P63173 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL38P63173 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL38P63173 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL38P63173 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL38P63173 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL38P63173 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL38P63173 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL38P63173 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL38P63173 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL38P63173 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL38P63173 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL38P63173 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL38P63173 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL38P63173 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL38P63173 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL38P63173 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RPL38P63173 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL38P63173 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL38P63173 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL38P63173 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL38P63173 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL38P63173 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL38P63173 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL38P63173 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL38P63173 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL38P63173 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL38P63173 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL38P63173 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL38P63173 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL38P63173 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL38P63173 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL38P63173 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL38P63173 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL38P63173 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL38P63173 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL38P63173 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL38P63173 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL38P63173 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL38P63173 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL38P63173 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL38P63173 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL38P63173 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL38P63173 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL38P63173 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL38P63173 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL38P63173 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL38P63173 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL38P63173 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL38P63173 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL38P63173 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL38P63173 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL38P63173 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL38P63173 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL38P63173 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL38P63173 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL38P63173 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL38P63173 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL38P63173 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL38P63173 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL38P63173 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL38P63173 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL38P63173 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL38P63173 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL38P63173 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL38P63173 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL38P63173 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL38P63173 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL38P63173 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL38P63173 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL38P63173 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms