Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNRPD1P62314 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPD1P62314 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms