Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UFM1P61960 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UFM1P61960 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UFM1P61960 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UFM1P61960 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UFM1P61960 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UFM1P61960 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UFM1P61960 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UFM1P61960 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UFM1P61960 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UFM1P61960 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UFM1P61960 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UFM1P61960 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UFM1P61960 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UFM1P61960 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UFM1P61960 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UFM1P61960 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UFM1P61960 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UFM1P61960 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
UFM1P61960 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UFM1P61960 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UFM1P61960 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UFM1P61960 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UFM1P61960 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UFM1P61960 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UFM1P61960 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UFM1P61960 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UFM1P61960 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UFM1P61960 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UFM1P61960 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UFM1P61960 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UFM1P61960 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UFM1P61960 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UFM1P61960 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UFM1P61960 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UFM1P61960 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UFM1P61960 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UFM1P61960 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UFM1P61960 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UFM1P61960 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UFM1P61960 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UFM1P61960 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UFM1P61960 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UFM1P61960 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFM1P61960 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFM1P61960 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFM1P61960 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFM1P61960 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFM1P61960 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFM1P61960 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFM1P61960 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFM1P61960 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UFM1P61960 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFM1P61960 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFM1P61960 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFM1P61960 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFM1P61960 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFM1P61960 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFM1P61960 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFM1P61960 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFM1P61960 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFM1P61960 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UFM1P61960 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UFM1P61960 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UFM1P61960 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UFM1P61960 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UFM1P61960 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UFM1P61960 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UFM1P61960 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UFM1P61960 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFM1P61960 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFM1P61960 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFM1P61960 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFM1P61960 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UFM1P61960 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFM1P61960 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFM1P61960 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFM1P61960 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UFM1P61960 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFM1P61960 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFM1P61960 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFM1P61960 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFM1P61960 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UFM1P61960 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFM1P61960 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UFM1P61960 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFM1P61960 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFM1P61960 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFM1P61960 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFM1P61960 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFM1P61960 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UFM1P61960 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UFM1P61960 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UFM1P61960 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UFM1P61960 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UFM1P61960 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFM1P61960 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFM1P61960 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFM1P61960 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFM1P61960 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms