Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVS71-1P61550 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ERVS71-1P61550 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms