Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS3AP61247 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS3AP61247 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS3AP61247 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS3AP61247 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms