Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRPS1P60891 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPS1P60891 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms