Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTENP60484 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTENP60484 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTENP60484 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTENP60484 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTENP60484 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTENP60484 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTENP60484 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTENP60484 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTENP60484 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTENP60484 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTENP60484 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTENP60484 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTENP60484 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTENP60484 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTENP60484 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTENP60484 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTENP60484 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTENP60484 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTENP60484 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTENP60484 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTENP60484 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTENP60484 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTENP60484 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTENP60484 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTENP60484 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTENP60484 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTENP60484 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTENP60484 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTENP60484 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTENP60484 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTENP60484 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTENP60484 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTENP60484 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTENP60484 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTENP60484 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTENP60484 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTENP60484 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTENP60484 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTENP60484 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTENP60484 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTENP60484 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTENP60484 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTENP60484 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTENP60484 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTENP60484 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTENP60484 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTENP60484 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTENP60484 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTENP60484 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTENP60484 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTENP60484 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTENP60484 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTENP60484 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTENP60484 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTENP60484 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTENP60484 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTENP60484 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTENP60484 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTENP60484 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTENP60484 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTENP60484 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTENP60484 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTENP60484 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTENP60484 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTENP60484 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTENP60484 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTENP60484 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTENP60484 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTENP60484 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTENP60484 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTENP60484 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTENP60484 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTENP60484 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTENP60484 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTENP60484 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTENP60484 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTENP60484 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTENP60484 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTENP60484 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTENP60484 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTENP60484 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTENP60484 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTENP60484 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTENP60484 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTENP60484 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTENP60484 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTENP60484 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTENP60484 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTENP60484 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTENP60484 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTENP60484 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTENP60484 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTENP60484 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTENP60484 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTENP60484 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTENP60484 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTENP60484 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTENP60484 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTENP60484 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms