Protein–RNA interactions for Protein: P59046

NLRP12, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP12P59046 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP12P59046 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP12P59046 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP12P59046 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP12P59046 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP12P59046 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP12P59046 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP12P59046 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP12P59046 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP12P59046 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP12P59046 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP12P59046 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP12P59046 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP12P59046 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP12P59046 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NLRP12P59046 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP12P59046 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP12P59046 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP12P59046 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP12P59046 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP12P59046 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP12P59046 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP12P59046 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP12P59046 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP12P59046 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP12P59046 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NLRP12P59046 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP12P59046 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP12P59046 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP12P59046 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP12P59046 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP12P59046 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP12P59046 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NLRP12P59046 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms