Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GSDMDP57764 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSDMDP57764 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms