Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBX4P57082 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBX4P57082 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBX4P57082 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBX4P57082 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBX4P57082 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBX4P57082 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBX4P57082 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBX4P57082 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBX4P57082 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TBX4P57082 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TBX4P57082 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TBX4P57082 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TBX4P57082 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TBX4P57082 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TBX4P57082 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TBX4P57082 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TBX4P57082 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TBX4P57082 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TBX4P57082 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TBX4P57082 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TBX4P57082 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TBX4P57082 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TBX4P57082 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TBX4P57082 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TBX4P57082 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TBX4P57082 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TBX4P57082 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TBX4P57082 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TBX4P57082 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TBX4P57082 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TBX4P57082 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TBX4P57082 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TBX4P57082 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TBX4P57082 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TBX4P57082 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TBX4P57082 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TBX4P57082 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TBX4P57082 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TBX4P57082 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TBX4P57082 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TBX4P57082 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TBX4P57082 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TBX4P57082 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TBX4P57082 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TBX4P57082 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TBX4P57082 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TBX4P57082 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TBX4P57082 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TBX4P57082 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TBX4P57082 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TBX4P57082 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TBX4P57082 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TBX4P57082 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TBX4P57082 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TBX4P57082 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TBX4P57082 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TBX4P57082 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TBX4P57082 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TBX4P57082 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TBX4P57082 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TBX4P57082 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TBX4P57082 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TBX4P57082 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TBX4P57082 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TBX4P57082 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TBX4P57082 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TBX4P57082 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TBX4P57082 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TBX4P57082 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TBX4P57082 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TBX4P57082 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TBX4P57082 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TBX4P57082 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TBX4P57082 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TBX4P57082 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TBX4P57082 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TBX4P57082 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TBX4P57082 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TBX4P57082 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TBX4P57082 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TBX4P57082 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TBX4P57082 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TBX4P57082 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TBX4P57082 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TBX4P57082 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TBX4P57082 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TBX4P57082 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TBX4P57082 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TBX4P57082 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TBX4P57082 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TBX4P57082 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TBX4P57082 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TBX4P57082 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TBX4P57082 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TBX4P57082 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TBX4P57082 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TBX4P57082 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TBX4P57082 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TBX4P57082 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms