Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARL4CP56559 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARL4CP56559 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARL4CP56559 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARL4CP56559 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARL4CP56559 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARL4CP56559 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARL4CP56559 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARL4CP56559 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARL4CP56559 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms