Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GFRA1P56159 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GFRA1P56159 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms