Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF10P55107 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF10P55107 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF10P55107 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF10P55107 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF10P55107 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF10P55107 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF10P55107 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GDF10P55107 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF10P55107 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GDF10P55107 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF10P55107 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF10P55107 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF10P55107 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF10P55107 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GDF10P55107 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF10P55107 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF10P55107 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF10P55107 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF10P55107 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF10P55107 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF10P55107 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF10P55107 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF10P55107 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GDF10P55107 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF10P55107 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF10P55107 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF10P55107 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF10P55107 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF10P55107 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF10P55107 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF10P55107 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GDF10P55107 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF10P55107 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF10P55107 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF10P55107 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF10P55107 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GDF10P55107 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDF10P55107 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GDF10P55107 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF10P55107 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF10P55107 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF10P55107 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF10P55107 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF10P55107 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF10P55107 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF10P55107 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF10P55107 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF10P55107 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GDF10P55107 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF10P55107 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF10P55107 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF10P55107 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF10P55107 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF10P55107 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF10P55107 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GDF10P55107 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF10P55107 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF10P55107 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF10P55107 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF10P55107 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF10P55107 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF10P55107 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF10P55107 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF10P55107 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GDF10P55107 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF10P55107 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF10P55107 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF10P55107 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF10P55107 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF10P55107 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF10P55107 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF10P55107 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF10P55107 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF10P55107 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF10P55107 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF10P55107 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF10P55107 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF10P55107 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF10P55107 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF10P55107 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF10P55107 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF10P55107 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF10P55107 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF10P55107 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF10P55107 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF10P55107 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF10P55107 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF10P55107 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF10P55107 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF10P55107 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF10P55107 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF10P55107 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF10P55107 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF10P55107 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF10P55107 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF10P55107 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF10P55107 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF10P55107 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF10P55107 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms