Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC12A2P55011 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC12A2P55011 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC12A2P55011 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC12A2P55011 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A2P55011 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A2P55011 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A2P55011 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A2P55011 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A2P55011 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A2P55011 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A2P55011 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A2P55011 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A2P55011 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A2P55011 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC12A2P55011 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC12A2P55011 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC12A2P55011 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC12A2P55011 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC12A2P55011 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC12A2P55011 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC12A2P55011 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC12A2P55011 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC12A2P55011 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms