Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A3P53794 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A3P53794 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC5A3P53794 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms