Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC25A1P53007 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC25A1P53007 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A1P53007 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A1P53007 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A1P53007 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A1P53007 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A1P53007 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A1P53007 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A1P53007 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A1P53007 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A1P53007 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A1P53007 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A1P53007 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A1P53007 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A1P53007 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A1P53007 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A1P53007 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A1P53007 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A1P53007 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A1P53007 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A1P53007 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A1P53007 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A1P53007 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A1P53007 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A1P53007 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A1P53007 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A1P53007 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A1P53007 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A1P53007 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A1P53007 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A1P53007 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A1P53007 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A1P53007 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A1P53007 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A1P53007 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A1P53007 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A1P53007 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A1P53007 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A1P53007 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A1P53007 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A1P53007 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A1P53007 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A1P53007 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A1P53007 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A1P53007 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A1P53007 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A1P53007 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms