Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NKX2-5P52952 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX2-5P52952 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX2-5P52952 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms