Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HK3P52790 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HK3P52790 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HK3P52790 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HK3P52790 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HK3P52790 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HK3P52790 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HK3P52790 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HK3P52790 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HK3P52790 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HK3P52790 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HK3P52790 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HK3P52790 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HK3P52790 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HK3P52790 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HK3P52790 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HK3P52790 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HK3P52790 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HK3P52790 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HK3P52790 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HK3P52790 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HK3P52790 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HK3P52790 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HK3P52790 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HK3P52790 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HK3P52790 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HK3P52790 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HK3P52790 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HK3P52790 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HK3P52790 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HK3P52790 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HK3P52790 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HK3P52790 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HK3P52790 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HK3P52790 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HK3P52790 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HK3P52790 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HK3P52790 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HK3P52790 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HK3P52790 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HK3P52790 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HK3P52790 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HK3P52790 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HK3P52790 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HK3P52790 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HK3P52790 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HK3P52790 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HK3P52790 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HK3P52790 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HK3P52790 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HK3P52790 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HK3P52790 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HK3P52790 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HK3P52790 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HK3P52790 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HK3P52790 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HK3P52790 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HK3P52790 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HK3P52790 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HK3P52790 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HK3P52790 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HK3P52790 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HK3P52790 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HK3P52790 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HK3P52790 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HK3P52790 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HK3P52790 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HK3P52790 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HK3P52790 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HK3P52790 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HK3P52790 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HK3P52790 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HK3P52790 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HK3P52790 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HK3P52790 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HK3P52790 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HK3P52790 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HK3P52790 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HK3P52790 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HK3P52790 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HK3P52790 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HK3P52790 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HK3P52790 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HK3P52790 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HK3P52790 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HK3P52790 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HK3P52790 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HK3P52790 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HK3P52790 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HK3P52790 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HK3P52790 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HK3P52790 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HK3P52790 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HK3P52790 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HK3P52790 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HK3P52790 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HK3P52790 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HK3P52790 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HK3P52790 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HK3P52790 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms