Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMSP52788 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMSP52788 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMSP52788 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMSP52788 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMSP52788 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMSP52788 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMSP52788 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMSP52788 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMSP52788 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMSP52788 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMSP52788 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMSP52788 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMSP52788 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMSP52788 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMSP52788 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMSP52788 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMSP52788 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMSP52788 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMSP52788 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMSP52788 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMSP52788 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMSP52788 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMSP52788 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMSP52788 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMSP52788 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMSP52788 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMSP52788 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMSP52788 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMSP52788 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMSP52788 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMSP52788 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMSP52788 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMSP52788 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMSP52788 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMSP52788 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMSP52788 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMSP52788 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMSP52788 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMSP52788 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMSP52788 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMSP52788 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMSP52788 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMSP52788 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMSP52788 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMSP52788 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMSP52788 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMSP52788 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMSP52788 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMSP52788 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMSP52788 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMSP52788 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMSP52788 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMSP52788 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMSP52788 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMSP52788 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMSP52788 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMSP52788 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMSP52788 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMSP52788 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMSP52788 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMSP52788 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMSP52788 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMSP52788 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMSP52788 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMSP52788 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMSP52788 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMSP52788 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMSP52788 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMSP52788 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMSP52788 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMSP52788 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMSP52788 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMSP52788 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMSP52788 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMSP52788 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMSP52788 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMSP52788 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMSP52788 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMSP52788 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMSP52788 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMSP52788 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMSP52788 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMSP52788 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMSP52788 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMSP52788 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMSP52788 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMSP52788 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMSP52788 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMSP52788 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMSP52788 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMSP52788 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMSP52788 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMSP52788 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMSP52788 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMSP52788 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMSP52788 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMSP52788 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMSP52788 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMSP52788 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms