Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 WASF1-209ENST00000444391 898 ntTSL 533.29■■■□□ 2.928e-8■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.488e-8■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 WASF1-208ENST00000419252 740 ntTSL 322.7■■□□□ 1.228e-8■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.228e-8■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.158e-8■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.038e-8■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 WASF1-203ENST00000368938 678 ntTSL 419.9■□□□□ 0.788e-8■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 WASF1-204ENST00000392586 2815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.068e-8■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.291e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.281e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.131e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-220ENST00000519767 970 ntTSL 1 (best)40.44■■■■■ 4.061e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.061e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 41e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 41e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 41e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 41e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 41e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 41e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 41e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 41e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.661e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.211e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.141e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 21e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.391e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-221ENST00000520265 336 ntTSL 522.27■■□□□ 1.161e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.071e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.971e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.791e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.761e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.761e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.761e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.721e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-215ENST00000497139 2746 ntTSL 1 (best)16.02■□□□□ 0.161e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-214ENST00000493786 551 ntTSL 211.6□□□□□ -0.551e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 VEGFA-212ENST00000480614 12167 ntTSL 1 (best)11.46□□□□□ -0.581e-12■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 BRF1-216ENST00000550208 1040 ntTSL 335.09■■■■□ 3.211e-19■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 TBC1D5-223ENST00000471679 435 ntTSL 436.43■■■■□ 3.423e-7■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 TBC1D5-227ENST00000485432 566 ntTSL 432.49■■■□□ 2.793e-7■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 TBC1D5-206ENST00000423331 588 ntTSL 421.73■■□□□ 1.073e-7■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 TBC1D5-225ENST00000480435 560 ntTSL 53.6□□□□□ -1.833e-7■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 SIN3B-205ENST00000595049 904 ntTSL 233.41■■■□□ 2.942e-18■■■■■ 34.3
HNRNPMP52272 GDI2-204ENST00000418688 636 ntTSL 518.75■□□□□ 0.591e-8■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 GDI2-209ENST00000609712 622 ntTSL 318.04■□□□□ 0.481e-8■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 GDI2-208ENST00000608581 634 ntTSL 313.93□□□□□ -0.181e-8■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 GDI2-201ENST00000380127 584 ntTSL 313.04□□□□□ -0.321e-8■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.461e-6■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.231e-6■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 SQLE-203ENST00000518931 554 ntTSL 46.51□□□□□ -1.371e-6■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 SQLE-204ENST00000520493 737 ntTSL 34.83□□□□□ -1.641e-6■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.958e-7■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 SMCO4-203ENST00000526869 374 ntTSL 1 (best)30.3■■■□□ 2.448e-7■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.124e-7■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 CTBP1-214ENST00000514495 564 ntTSL 244.1■■■■■ 4.659e-8■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.052e-7■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.612e-7■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 CTBP1-217ENST00000515399 985 ntTSL 330.78■■■□□ 2.529e-8■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 CTBP1-208ENST00000506180 843 ntTSL 529.41■■■□□ 2.32e-7■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 CTBP1-212ENST00000513420 704 ntTSL 323.55■■□□□ 1.369e-8■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 CTBP1-213ENST00000514210 856 ntTSL 223.53■■□□□ 1.369e-8■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 HDLBP-217ENST00000430918 612 ntTSL 316.51■□□□□ 0.234e-7■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 BACH1-210ENST00000547141 315 ntTSL 27.49□□□□□ -1.212e-7■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.472e-7■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 BACH1-213ENST00000550131 349 ntTSL 24.06□□□□□ -1.762e-7■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 BACH1-211ENST00000548219 325 ntTSL 23.45□□□□□ -1.862e-7■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 BACH1-209ENST00000546469 485 ntTSL 33.45□□□□□ -1.862e-7■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 ARID1B-225ENST00000637532 445 ntTSL 517.47■□□□□ 0.395e-7■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 FARP2-217ENST00000479427 839 ntTSL 333.87■■■■□ 3.018e-7■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 FARP2-216ENST00000478489 617 ntTSL 331.56■■■□□ 2.648e-7■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.378e-7■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.558e-7■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 FARP2-209ENST00000464142 442 ntTSL 318.62■□□□□ 0.578e-7■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 FARP2-205ENST00000418082 456 ntTSL 416.24■□□□□ 0.198e-7■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 FARP2-208ENST00000445489 538 ntTSL 215.76■□□□□ 0.118e-7■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 FARP2-221ENST00000492868 556 ntTSL 412.33□□□□□ -0.448e-7■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 FARP2-213ENST00000473082 397 ntTSL 38.17□□□□□ -1.18e-7■■■■■ 34.2
HNRNPMP52272 TRAPPC9-203ENST00000517667 518 ntTSL 318.74■□□□□ 0.599e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 TRAPPC9-207ENST00000520532 560 ntTSL 511.53□□□□□ -0.569e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 MAPK12-204ENST00000467891 2019 ntTSL 540.94■■■■■ 4.153e-10■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.933e-10■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 MAPK12-206ENST00000488504 1785 ntTSL 533.52■■■□□ 2.963e-10■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.83e-10■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.523e-10■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 MAPK12-210ENST00000497738 2021 ntTSL 1 (best)29.45■■■□□ 2.313e-10■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 MAPK12-205ENST00000482969 2101 ntTSL 226.06■■□□□ 1.763e-10■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 MAPK12-208ENST00000496942 2763 ntTSL 224.02■■□□□ 1.443e-10■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 MAPK12-209ENST00000497036 6248 ntTSL 223.23■■□□□ 1.313e-10■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.993e-10■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.663e-10■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 UVRAG-209ENST00000533454 1823 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.373e-10■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 UVRAG-207ENST00000531818 3152 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 03e-10■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 UVRAG-208ENST00000532130 1831 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.283e-10■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 CHSY1-205ENST00000561143 819 ntTSL 211.68□□□□□ -0.543e-11■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.093e-10■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 SMYD3-206ENST00000455277 566 ntTSL 514.3□□□□□ -0.123e-7■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 SBF2-201ENST00000256190 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.592e-8■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 SBF2-214ENST00000533770 4829 ntTSL 1 (best)4.26□□□□□ -1.732e-8■■■■■ 34.1
HNRNPMP52272 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.813e-8■■■■■ 34.1
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 318.9 ms