Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEK4P51957 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEK4P51957 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEK4P51957 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEK4P51957 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEK4P51957 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEK4P51957 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEK4P51957 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEK4P51957 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEK4P51957 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEK4P51957 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEK4P51957 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEK4P51957 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEK4P51957 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEK4P51957 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEK4P51957 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEK4P51957 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEK4P51957 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEK4P51957 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEK4P51957 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEK4P51957 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEK4P51957 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEK4P51957 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEK4P51957 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEK4P51957 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEK4P51957 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEK4P51957 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEK4P51957 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEK4P51957 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEK4P51957 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEK4P51957 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEK4P51957 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEK4P51957 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEK4P51957 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEK4P51957 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEK4P51957 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEK4P51957 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEK4P51957 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NEK4P51957 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEK4P51957 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEK4P51957 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEK4P51957 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEK4P51957 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEK4P51957 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEK4P51957 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEK4P51957 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEK4P51957 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEK4P51957 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NEK4P51957 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEK4P51957 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEK4P51957 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEK4P51957 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEK4P51957 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEK4P51957 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEK4P51957 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEK4P51957 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEK4P51957 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEK4P51957 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEK4P51957 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEK4P51957 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEK4P51957 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEK4P51957 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEK4P51957 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEK4P51957 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEK4P51957 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEK4P51957 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NEK4P51957 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEK4P51957 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEK4P51957 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEK4P51957 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEK4P51957 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEK4P51957 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEK4P51957 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEK4P51957 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NEK4P51957 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEK4P51957 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEK4P51957 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEK4P51957 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEK4P51957 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NEK4P51957 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEK4P51957 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEK4P51957 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEK4P51957 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NEK4P51957 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEK4P51957 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEK4P51957 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEK4P51957 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEK4P51957 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEK4P51957 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEK4P51957 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEK4P51957 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEK4P51957 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEK4P51957 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NEK4P51957 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEK4P51957 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEK4P51957 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEK4P51957 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEK4P51957 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEK4P51957 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEK4P51957 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms