Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2D1P51668 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2D1P51668 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms