Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB28P51157 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB28P51157 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB28P51157 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB28P51157 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB28P51157 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB28P51157 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB28P51157 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB28P51157 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB28P51157 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB28P51157 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB28P51157 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB28P51157 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB28P51157 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB28P51157 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB28P51157 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB28P51157 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB28P51157 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB28P51157 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB28P51157 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB28P51157 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB28P51157 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB28P51157 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB28P51157 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB28P51157 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB28P51157 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB28P51157 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB28P51157 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB28P51157 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB28P51157 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB28P51157 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB28P51157 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB28P51157 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB28P51157 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB28P51157 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB28P51157 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB28P51157 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB28P51157 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB28P51157 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB28P51157 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB28P51157 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB28P51157 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB28P51157 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB28P51157 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB28P51157 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB28P51157 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB28P51157 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB28P51157 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB28P51157 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB28P51157 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB28P51157 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB28P51157 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB28P51157 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB28P51157 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB28P51157 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB28P51157 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB28P51157 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB28P51157 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB28P51157 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB28P51157 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB28P51157 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB28P51157 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB28P51157 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB28P51157 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB28P51157 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB28P51157 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB28P51157 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB28P51157 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB28P51157 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB28P51157 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB28P51157 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB28P51157 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB28P51157 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB28P51157 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB28P51157 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB28P51157 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB28P51157 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB28P51157 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB28P51157 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB28P51157 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB28P51157 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB28P51157 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB28P51157 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB28P51157 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB28P51157 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB28P51157 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB28P51157 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB28P51157 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB28P51157 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB28P51157 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB28P51157 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB28P51157 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB28P51157 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB28P51157 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB28P51157 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB28P51157 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB28P51157 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB28P51157 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB28P51157 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB28P51157 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms