Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK7P50613 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK7P50613 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK7P50613 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK7P50613 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK7P50613 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK7P50613 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK7P50613 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK7P50613 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK7P50613 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK7P50613 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK7P50613 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK7P50613 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK7P50613 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK7P50613 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK7P50613 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK7P50613 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK7P50613 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK7P50613 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK7P50613 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK7P50613 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK7P50613 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK7P50613 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK7P50613 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
CDK7P50613 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK7P50613 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK7P50613 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK7P50613 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK7P50613 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK7P50613 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK7P50613 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK7P50613 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK7P50613 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK7P50613 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK7P50613 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK7P50613 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK7P50613 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK7P50613 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK7P50613 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK7P50613 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK7P50613 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK7P50613 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK7P50613 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK7P50613 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK7P50613 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK7P50613 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK7P50613 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK7P50613 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK7P50613 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK7P50613 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK7P50613 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK7P50613 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK7P50613 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK7P50613 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK7P50613 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK7P50613 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK7P50613 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK7P50613 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK7P50613 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK7P50613 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK7P50613 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK7P50613 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK7P50613 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK7P50613 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK7P50613 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK7P50613 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK7P50613 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK7P50613 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK7P50613 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK7P50613 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK7P50613 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK7P50613 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK7P50613 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK7P50613 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK7P50613 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK7P50613 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK7P50613 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK7P50613 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK7P50613 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK7P50613 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK7P50613 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK7P50613 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK7P50613 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK7P50613 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK7P50613 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK7P50613 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK7P50613 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK7P50613 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK7P50613 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK7P50613 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK7P50613 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK7P50613 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK7P50613 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK7P50613 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK7P50613 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK7P50613 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK7P50613 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK7P50613 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK7P50613 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK7P50613 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms