Protein–RNA interactions for Protein: P50395

GDI2, Rab GDP dissociation inhibitor beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI2P50395 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDI2P50395 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDI2P50395 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDI2P50395 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDI2P50395 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDI2P50395 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDI2P50395 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDI2P50395 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDI2P50395 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDI2P50395 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDI2P50395 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDI2P50395 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDI2P50395 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GDI2P50395 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDI2P50395 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDI2P50395 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDI2P50395 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDI2P50395 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDI2P50395 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDI2P50395 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDI2P50395 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDI2P50395 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDI2P50395 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDI2P50395 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDI2P50395 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDI2P50395 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDI2P50395 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDI2P50395 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDI2P50395 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDI2P50395 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDI2P50395 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDI2P50395 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDI2P50395 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDI2P50395 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDI2P50395 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDI2P50395 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDI2P50395 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDI2P50395 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDI2P50395 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDI2P50395 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDI2P50395 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDI2P50395 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDI2P50395 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDI2P50395 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GDI2P50395 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDI2P50395 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDI2P50395 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDI2P50395 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDI2P50395 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDI2P50395 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDI2P50395 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDI2P50395 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDI2P50395 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GDI2P50395 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDI2P50395 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDI2P50395 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDI2P50395 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDI2P50395 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDI2P50395 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDI2P50395 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDI2P50395 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDI2P50395 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDI2P50395 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDI2P50395 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDI2P50395 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDI2P50395 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDI2P50395 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDI2P50395 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDI2P50395 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDI2P50395 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDI2P50395 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDI2P50395 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDI2P50395 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDI2P50395 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDI2P50395 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDI2P50395 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDI2P50395 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDI2P50395 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GDI2P50395 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDI2P50395 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDI2P50395 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDI2P50395 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDI2P50395 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDI2P50395 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDI2P50395 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDI2P50395 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GDI2P50395 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDI2P50395 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDI2P50395 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDI2P50395 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDI2P50395 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDI2P50395 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDI2P50395 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDI2P50395 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDI2P50395 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDI2P50395 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDI2P50395 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GDI2P50395 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDI2P50395 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDI2P50395 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms