Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IDH3AP50213 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IDH3AP50213 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IDH3AP50213 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms