Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSNK1EP49674 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSNK1EP49674 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSNK1EP49674 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSNK1EP49674 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms