Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRIM1P49642 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRIM1P49642 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PRIM1P49642 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms