Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNTBP49356 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNTBP49356 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNTBP49356 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNTBP49356 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNTBP49356 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNTBP49356 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNTBP49356 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNTBP49356 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNTBP49356 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNTBP49356 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNTBP49356 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNTBP49356 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FNTBP49356 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNTBP49356 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FNTBP49356 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNTBP49356 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNTBP49356 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNTBP49356 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNTBP49356 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNTBP49356 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNTBP49356 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNTBP49356 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNTBP49356 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNTBP49356 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNTBP49356 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FNTBP49356 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNTBP49356 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNTBP49356 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNTBP49356 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FNTBP49356 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNTBP49356 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNTBP49356 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNTBP49356 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNTBP49356 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNTBP49356 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNTBP49356 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNTBP49356 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNTBP49356 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNTBP49356 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNTBP49356 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNTBP49356 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNTBP49356 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNTBP49356 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNTBP49356 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNTBP49356 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FNTBP49356 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNTBP49356 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FNTBP49356 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNTBP49356 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNTBP49356 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNTBP49356 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNTBP49356 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNTBP49356 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNTBP49356 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNTBP49356 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNTBP49356 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNTBP49356 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNTBP49356 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNTBP49356 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNTBP49356 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNTBP49356 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNTBP49356 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNTBP49356 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNTBP49356 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNTBP49356 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNTBP49356 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNTBP49356 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNTBP49356 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNTBP49356 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNTBP49356 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNTBP49356 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNTBP49356 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNTBP49356 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNTBP49356 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNTBP49356 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNTBP49356 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNTBP49356 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNTBP49356 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNTBP49356 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNTBP49356 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FNTBP49356 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNTBP49356 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNTBP49356 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNTBP49356 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FNTBP49356 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FNTBP49356 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNTBP49356 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNTBP49356 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNTBP49356 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNTBP49356 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNTBP49356 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNTBP49356 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNTBP49356 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNTBP49356 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNTBP49356 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNTBP49356 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNTBP49356 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNTBP49356 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNTBP49356 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms