Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNC1P48547 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNC1P48547 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNC1P48547 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms