Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRXP46100 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRXP46100 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRXP46100 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRXP46100 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRXP46100 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRXP46100 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRXP46100 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRXP46100 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRXP46100 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRXP46100 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRXP46100 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRXP46100 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRXP46100 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRXP46100 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRXP46100 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRXP46100 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRXP46100 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRXP46100 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRXP46100 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRXP46100 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRXP46100 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRXP46100 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRXP46100 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRXP46100 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRXP46100 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRXP46100 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRXP46100 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRXP46100 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRXP46100 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRXP46100 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRXP46100 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRXP46100 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRXP46100 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRXP46100 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRXP46100 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRXP46100 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRXP46100 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRXP46100 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRXP46100 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRXP46100 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRXP46100 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRXP46100 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRXP46100 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRXP46100 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRXP46100 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRXP46100 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRXP46100 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRXP46100 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATRXP46100 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATRXP46100 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATRXP46100 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATRXP46100 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATRXP46100 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRXP46100 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRXP46100 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRXP46100 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRXP46100 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRXP46100 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRXP46100 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRXP46100 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRXP46100 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRXP46100 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRXP46100 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRXP46100 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRXP46100 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRXP46100 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRXP46100 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRXP46100 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRXP46100 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRXP46100 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRXP46100 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRXP46100 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRXP46100 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRXP46100 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRXP46100 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRXP46100 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRXP46100 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRXP46100 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRXP46100 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRXP46100 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRXP46100 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRXP46100 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRXP46100 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRXP46100 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATRXP46100 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRXP46100 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRXP46100 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRXP46100 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRXP46100 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRXP46100 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRXP46100 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRXP46100 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRXP46100 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRXP46100 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRXP46100 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRXP46100 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRXP46100 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRXP46100 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRXP46100 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms