Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RECQLP46063 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RECQLP46063 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RECQLP46063 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RECQLP46063 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RECQLP46063 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RECQLP46063 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RECQLP46063 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RECQLP46063 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RECQLP46063 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RECQLP46063 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RECQLP46063 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RECQLP46063 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RECQLP46063 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RECQLP46063 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RECQLP46063 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RECQLP46063 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RECQLP46063 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RECQLP46063 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RECQLP46063 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RECQLP46063 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RECQLP46063 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RECQLP46063 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RECQLP46063 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RECQLP46063 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RECQLP46063 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RECQLP46063 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RECQLP46063 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RECQLP46063 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RECQLP46063 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RECQLP46063 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RECQLP46063 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RECQLP46063 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RECQLP46063 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RECQLP46063 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RECQLP46063 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RECQLP46063 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RECQLP46063 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RECQLP46063 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RECQLP46063 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RECQLP46063 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RECQLP46063 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RECQLP46063 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RECQLP46063 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RECQLP46063 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RECQLP46063 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RECQLP46063 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RECQLP46063 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RECQLP46063 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RECQLP46063 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RECQLP46063 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RECQLP46063 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RECQLP46063 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RECQLP46063 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RECQLP46063 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RECQLP46063 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RECQLP46063 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RECQLP46063 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RECQLP46063 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RECQLP46063 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RECQLP46063 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RECQLP46063 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RECQLP46063 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RECQLP46063 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RECQLP46063 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RECQLP46063 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RECQLP46063 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RECQLP46063 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RECQLP46063 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RECQLP46063 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RECQLP46063 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RECQLP46063 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RECQLP46063 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RECQLP46063 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RECQLP46063 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RECQLP46063 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RECQLP46063 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RECQLP46063 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RECQLP46063 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RECQLP46063 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RECQLP46063 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RECQLP46063 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RECQLP46063 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RECQLP46063 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RECQLP46063 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RECQLP46063 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RECQLP46063 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RECQLP46063 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RECQLP46063 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RECQLP46063 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RECQLP46063 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RECQLP46063 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RECQLP46063 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RECQLP46063 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RECQLP46063 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RECQLP46063 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RECQLP46063 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RECQLP46063 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RECQLP46063 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RECQLP46063 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.4 ms