Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MKI67P46013 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MKI67P46013 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKI67P46013 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MKI67P46013 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MKI67P46013 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKI67P46013 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKI67P46013 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKI67P46013 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKI67P46013 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKI67P46013 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKI67P46013 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKI67P46013 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKI67P46013 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKI67P46013 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKI67P46013 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKI67P46013 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MKI67P46013 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MKI67P46013 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MKI67P46013 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MKI67P46013 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MKI67P46013 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MKI67P46013 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MKI67P46013 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MKI67P46013 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MKI67P46013 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MKI67P46013 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MKI67P46013 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MKI67P46013 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MKI67P46013 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MKI67P46013 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKI67P46013 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKI67P46013 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKI67P46013 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKI67P46013 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKI67P46013 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKI67P46013 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MKI67P46013 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MKI67P46013 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MKI67P46013 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MKI67P46013 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MKI67P46013 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MKI67P46013 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MKI67P46013 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MKI67P46013 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKI67P46013 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKI67P46013 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKI67P46013 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKI67P46013 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKI67P46013 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKI67P46013 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKI67P46013 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKI67P46013 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKI67P46013 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKI67P46013 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKI67P46013 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKI67P46013 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MKI67P46013 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKI67P46013 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MKI67P46013 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MKI67P46013 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MKI67P46013 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MKI67P46013 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKI67P46013 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKI67P46013 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKI67P46013 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKI67P46013 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKI67P46013 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKI67P46013 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKI67P46013 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKI67P46013 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKI67P46013 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MKI67P46013 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKI67P46013 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKI67P46013 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKI67P46013 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKI67P46013 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MKI67P46013 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKI67P46013 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKI67P46013 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKI67P46013 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKI67P46013 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKI67P46013 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MKI67P46013 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKI67P46013 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKI67P46013 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKI67P46013 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKI67P46013 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKI67P46013 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKI67P46013 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKI67P46013 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKI67P46013 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKI67P46013 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKI67P46013 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MKI67P46013 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKI67P46013 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKI67P46013 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKI67P46013 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKI67P46013 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKI67P46013 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms