Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPD2P43304 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPD2P43304 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPD2P43304 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPD2P43304 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPD2P43304 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPD2P43304 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPD2P43304 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPD2P43304 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GPD2P43304 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPD2P43304 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPD2P43304 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPD2P43304 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPD2P43304 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPD2P43304 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPD2P43304 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPD2P43304 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPD2P43304 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPD2P43304 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPD2P43304 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GPD2P43304 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPD2P43304 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPD2P43304 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPD2P43304 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPD2P43304 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPD2P43304 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPD2P43304 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPD2P43304 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPD2P43304 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GPD2P43304 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPD2P43304 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPD2P43304 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPD2P43304 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPD2P43304 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPD2P43304 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPD2P43304 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPD2P43304 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPD2P43304 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPD2P43304 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPD2P43304 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPD2P43304 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPD2P43304 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPD2P43304 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPD2P43304 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPD2P43304 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPD2P43304 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPD2P43304 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPD2P43304 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPD2P43304 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPD2P43304 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPD2P43304 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPD2P43304 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GPD2P43304 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPD2P43304 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPD2P43304 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPD2P43304 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPD2P43304 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPD2P43304 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPD2P43304 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPD2P43304 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPD2P43304 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GPD2P43304 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPD2P43304 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPD2P43304 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPD2P43304 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GPD2P43304 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPD2P43304 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPD2P43304 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GPD2P43304 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPD2P43304 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPD2P43304 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPD2P43304 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPD2P43304 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPD2P43304 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPD2P43304 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPD2P43304 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPD2P43304 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPD2P43304 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPD2P43304 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPD2P43304 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPD2P43304 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPD2P43304 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPD2P43304 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPD2P43304 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPD2P43304 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPD2P43304 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPD2P43304 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GPD2P43304 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPD2P43304 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPD2P43304 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPD2P43304 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPD2P43304 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GPD2P43304 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPD2P43304 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPD2P43304 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPD2P43304 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPD2P43304 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPD2P43304 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPD2P43304 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPD2P43304 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms