Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRATP43155 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRATP43155 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRATP43155 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRATP43155 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRATP43155 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRATP43155 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRATP43155 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRATP43155 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRATP43155 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRATP43155 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRATP43155 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRATP43155 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRATP43155 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRATP43155 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CRATP43155 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRATP43155 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRATP43155 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRATP43155 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRATP43155 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRATP43155 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRATP43155 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRATP43155 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRATP43155 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRATP43155 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRATP43155 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRATP43155 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRATP43155 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRATP43155 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRATP43155 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRATP43155 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRATP43155 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRATP43155 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRATP43155 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRATP43155 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRATP43155 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRATP43155 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRATP43155 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRATP43155 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CRATP43155 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRATP43155 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRATP43155 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRATP43155 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRATP43155 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRATP43155 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRATP43155 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRATP43155 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRATP43155 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRATP43155 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRATP43155 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRATP43155 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRATP43155 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRATP43155 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRATP43155 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRATP43155 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRATP43155 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRATP43155 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRATP43155 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRATP43155 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRATP43155 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRATP43155 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRATP43155 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRATP43155 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRATP43155 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRATP43155 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRATP43155 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRATP43155 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CRATP43155 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRATP43155 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRATP43155 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRATP43155 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRATP43155 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CRATP43155 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRATP43155 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRATP43155 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRATP43155 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRATP43155 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRATP43155 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRATP43155 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRATP43155 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRATP43155 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRATP43155 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRATP43155 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRATP43155 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRATP43155 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRATP43155 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRATP43155 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CRATP43155 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CRATP43155 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRATP43155 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRATP43155 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRATP43155 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRATP43155 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRATP43155 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRATP43155 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRATP43155 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRATP43155 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRATP43155 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRATP43155 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRATP43155 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms